干货分享危机一发(危机一发后篇)

鼠·传·人

 

❶ 前言老铁们，周末好啊~今天咱接着给《纽约下水道危机一发》补一个尾巴前两集见这里：[独家原创]纽约：下水道危机一发（引子）[独家原创]纽约：下水道危机一发（正传）在前两集里面，咱主要八卦了纽约下水道废水检测发现的一些有可能。

宿主是鼠类的神秘变异株但其实之前咱在其他地方贩卖这坨焦虑的时候，就收到过下面这样的灵魂拷问：“可是拍老师，到目前为止，还没有鼠传人的实锤啊？”…………咱当时就被拷问得一愣一愣的……毕竟，在之前很长一段时间里，。

由于全球大多数地方都实质性放弃了流调工作，所以确实没有鼠传人（以及其他很多动物宿主回传人类）的实锤，但很凑巧，现在已经有了，而且马上就要发在《柳叶刀》上，下面咱就仔细八卦得了~❷ 鼠·传·人今天咱们要八卦的鼠传人实锤，

各位想必已经大致听说过了，咱们这边之前也提过一嘴，请看这里：香港，仓鼠的末路以及这里：香港仓鼠事件的一点更新简而言之，这事儿的来龙去脉是这样的：最开始，铜锣湾某宠物店的店员检出新冠病毒阳性；一通流调下来，店员桑还是感染路径不明，于是

渔护署果断到店采样，结果……一共125份动物样本里面，有11份阳性，阳性样本全部来自叙利亚仓鼠；涉事仓鼠分为两批次，于2021年12月22日和2022年1月7日从荷兰进口；接下来，这家宠物店在大埔有个仓库，渔护署继续跑到仓库去采了500多份动物和环境样本，结果发现多个环境样本阳性，其中包括仓鼠专用食盆；

注意，最早检出阳性的店员桑，从未到过该仓库；接下来香港再次发现涉及该宠物店的阳性病例，为一对顾客母女其中女儿于1月4日到店购买仓鼠；之后母女两人于1月8日再次到店购买饲料和仓鼠笼第二次到店时负责接待的正是上述阳性店员。

期间双方间隔约1米，上述母女均已确诊，其中母亲1月12日发病，1月14日自行前往医院采检，1月16日检出阳性；女儿则至今无症状后来发现他们同住的男主人也不幸确诊；基于以上情况，香港渔护署决定扑杀大概两千只仓鼠、暂停小型宠物进口和销售，并且对该宠物店的到店客人全部做检测；。

但很可惜，上述措施并没有组织感染链继续蔓延……截止2022年2月，这条由仓鼠到人类、由欧洲到香港的感染事件，已经在众目睽睽之下造成了至少50例人类感染（外加十来例仓鼠感染）总结总结就是，香港在1-2月份期间，。

经历了一次由境外进口仓鼠引发的，动物宿主回传新冠病毒到人类，并造成社区续发传播的事件~而这也是大流行以来第一次实锤的宠物回传人类事件~至于之前有没有发生过类似事件？或者说，Alpha、Omicron这类变异株是不是起源于动物回传？

这谁说得清呢……毕竟在咱这个拉胯的魔幻现实主义世界里头，并不是什么事情都能奢望能拿到实锤。扯淡完毕，咱回头看看港大潘烈文老师领衔搞的这篇即将登上《柳叶刀》的预印本呗~——请品鉴：

标题：新冠病毒Delta变异株从宠物仓鼠到人类的传播，以及续发的人传人：一项案例分析简而言之，潘老师他们给被这起传播事件波及到的仓鼠和人类做了全基因组测序和血清抗体检测，然后详细分析了人类部分感染链的流调结果，

最后通过撸系统发生树的黑科技手段，最大程度还原了这起跨大洲、跨物种传播事件的来龙去脉~——请继续品鉴：

翻译成人话：相关这批进口高档黄金仓鼠，阳性率超过5成；仓鼠们所在的鼠笼等环境样本，阳性率更是高达7成左右；除这批进口仓鼠之外，涉事宠物店的其他所有宠物（包括其他批次的仓鼠）以及相关环境样本均为阴性；本事件涉及的变异株是Delta（AY.127）;

撸系统发生树的结果：这批仓鼠感染病毒的时间大约是2021年11月下旬；撸数+流调的共同结果：仓鼠们抵港后，造成了至少两起相互独立的鼠传人事件，并且其中一起的感染链已经蔓延到社区

——一图秒懂（可能需要点开大图）：

——以及，实锤来了：

↑ 系统发生树~简单来说，以上的绿色部分是仓鼠身上检出的病毒，紫红色则是香港人身上检出的病毒~演化树上的距离越近，则可以粗略理解为亲缘关系越近所以显而易见，正如潘老师所言，鼠传人确实发生了两次~然后最接近的毒株也确实是在欧洲（捷克/斯洛伐克/德国那一带）……。

当然，以上其实咱们早在一个月之前就抢跑过了

——请品鉴：

所以咯，情况就是这么一种情况，潘老师的系统发生树生动地说明了：人传鼠是没问题的（AY.127最早起源于人类）；鼠传鼠也是没问题的；鼠群罹患率刷到五成也是没问题的（毕竟Delta）；感染链在小鼠鼠之间持续至少两个月时间还是没问题的；

带毒鼠类跨大洲传毒仍然是没问题的；接下来，鼠传人又是没问题的；最后，鼠传人之后继续形成社区传播链，很不幸还是没问题的……

❸ 夹带私货的跨物种传播话说，之前咱在贩卖关于跨物种传播的焦虑时，也曾经收到过这样的灵魂拷问：“可是拍老师，反正现在被其他人类传染新冠病毒的风险，远远高于被动物（尤其是宠物）传染，那为啥需要关注跨物种传播的小概率事件呢

？”这个问题其实问的挺好，现在正好有香港的现成例子在，咱就顺便掰扯几句吧~我们知道，就算同为哺乳动物，人和老鼠的体内生理环境，特别是免疫系统，是有明显不同的所以每当病毒进入新的宿主群体后，宿主体内生理环境和免疫系统的明显区别，。

就构成了对病毒的强大选择压。病毒需要尽快适应新的生存环境，因此往往会迅速累积出大量适应性突变。而这些适应性突变，在回传到原来的宿主时，谁也说不清会带来怎么样的功能变化……——比如说，请品鉴：

↑ 以上是本次仓鼠传毒事件的罪魁祸首，AY.127但它又不是普通款的AY.127，而是在短短两个月时间内就被仓鼠加了不少料的魔改版AY.127如上图红框所示，这货比起原版整整多出了20多个突变，形成了高达。

14个氨基酸层面的变化，其中3个位于刺突蛋白四舍五入一下，相当于新冠病毒常规情况下突变速率的8-10倍而且吧，仓鼠本来就对新冠病毒各种变异株都高度易感，以至于各大实验室都爱拿仓鼠来做动物模型~（比如说前两天刚刚八卦的港大袁老师就是典型的例子……）。

而从另外一个角度来说，既然天生就高度易感，那么病毒自然不需要额外花力气去搞适应性突变，所以仓鼠身上能够累积下来的突变数量应该不算特别夸张~可是哪怕这样，香港特供魔改版AY.127，还是在两个月时间内爆出了八倍速，

夹带了十几个氨基酸变异……那么各位不妨想象一下，如果跨物种回传的主角变成了大鼠之类的玩意儿，突变速率会不会更夸张？累积下来的突变会不会更阴间？——比如说昨天提到的纽约下水道神秘序列之一，请品鉴：

——再比如说，大佬Robert Garry老师搞的合订本，请再品鉴：

❹ 错乱的世界哦对了，顺便一提，跨物种传播的影响范围，可能还不止是人和宠物（以及老鼠），还包括了几乎整个生态圈。——举个新鲜出炉的栗子：

↑ 以上是加拿大安大略省近期上传的鹿类感染新冠病毒的全基因组序列首先，这枚倒霉的小鹿鹿，感染的是早已在人类世界绝迹一年多的古老变异株；（也就是说这只鹿不是近期被人类感染的……）然后，为什么鹿身上检出的病毒，。

却具有水貂的招牌适应性突变S:F486L和S:N501T？？？